Her sistemde oldugu gibi CNC tezgah ve sistemlerinin avantajlari yaninda bazi dezavantajlari mevcuttur. Bunlar sunlardir;

• Detayli bir imalat plani gereklidir.
• Pahali bir yatirimi gerektirir.
• Tezgahin saat ucreti yuksektir.
• Konvensiyonel tezgahlara kiyaslandiginda daha titiz kullanim ve bakim isterler.
• Kesme hizlari yuksek ve kaliteli kesicilerin kullanilmasi gerekir.
• Peryodik bakimlari uzman ve yetkili kisiler tarafindan duzenli olarak yapilmalidir.